Axe CBC - Contrôle Biologique par Conservation

Le personnes de l'axe CBC.

Les recherches de l’Axe CBC visent à comprendre le fonctionnement de la biodiversité dans les agroécosystèmes via l’analyse des facteurs locaux et paysagers qui affectent les ravageurs avec un focus sur leur régulation par les ennemis naturels dans un contexte d’évolution des pratiques agricoles.

De nombreux travaux indiquent que l’organisation spatiale des paysages agricoles, les pratiques et leur évolution dans le temps impactent la biodiversité (dont les ravageurs et les auxiliaires des cultures) et les services qu’elle rend à l’agriculture. La plupart de ces résultats ont été obtenus en cultures annuelles. Nous nous intéressons à cette question en cultures pérennes, des cultures plus stables dans le temps et l’espace.

En couplant observations de terrain et analyses statistiques de données, nous nous intéressons, par des approches d’écologie spatiale, à l’effet de la structure du paysage (distribution spatiale des habitats semi-naturels, des cultures et des pratiques agricoles) sur les ravageurs, les auxiliaires, les communautés d’oiseaux et le service de régulation des ravageurs. Par des approches de modélisation, nous tentons d’appréhender les conséquences possibles de changements de pratiques sur la biodiversité ou le contrôle des ravageurs. Nos travaux portent aussi sur les effets non intentionnels des pratiques agricoles sur la biodiversité, que ce soient les auxiliaires, les ravageurs non-ciblés et les résistances des insectes ravageurs. En particulier, par des approches de génétique/génomique des populations, nous cherchons à comprendre les dynamiques des résistances aux (bio)insecticides.

Nous nous appuyons sur des expérimentations ainsi que sur des suivis en parcelles commerciales dans le site atelier Basse Vallée de la Durance (440 km²), au cœur de la principale zone de production horticole en région PACA. Ce dispositif est au cœur de notre projet de recherche. Nous y suivons l’évolution de l’occupation du sol via des approches de géomatique, et réalisons, depuis 2006, des suivis écologiques ainsi que des pratiques agricoles dans un réseau de vergers commerciaux. Nous nous appuyons en particulier sur nos partenaires techniques et des réseaux de producteurs pour construire des projets de recherche-innovation-action. Nous effectuons également des expérimentations en conditions contrôlées et des caractérisations de populations dans l’insectarium de l’unité.

Nous étendons actuellement nos questions de recherche en prenant en compte les dynamiques temporelles des paysages et des pratiques et en recherchant les processus associés aux changements de biodiversité par une approche fonctionnelle de la biodiversité. Nous chercherons en particulier à comprendre comment les évolutions des stratégies de phytoprotection en vergers (changements de pesticides, mises en œuvre de pratiques alternatives) et leurs distributions dans les paysages, impactent la biodiversité, avec un point d’attention particulier sur la stabilité des communautés de ravageurs, d’auxiliaires et d’espèces constituant la biodiversité dite ‘ordinaire’.

Notre projet se décline en 3 thèmes détaillés ci-dessous :

• Comprendre l’influence de l’organisation spatio-temporelle des pratiques et du paysage sur la dynamique de la biodiversité
• Caractériser les effets non-intentionnels (ENI) des pratiques sur les ravageurs
• Combinaison de pratiques de protections des plantes au contrôle biologique par conservation

THÈSES DANS L'AXE CBC:

• MONTAINE DELMOTTE:

Intitulé de thèse: "Favoriser durablement la lutte biologique en verger de pommiers par les chiroptères : de la parcelle au paysage".

Financements: INRAE (Institut National pour la Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement)

Dates: 01/11/2024 au 31/10/2027

Objectifs: Les chauves-souris consomment un large panel de ravageurs. Cependant, un fort déclin des populations de chauves-souris est documenté à l’échelle nationale (43%) soulignant des enjeux de conservation, mais également de pertes de régulation des ravageurs. Dans ce projet, nous proposons donc d’étudier plus finement les interactions entre chauves-souris, arthropodes (ravageurs), pratiques agricoles et paysage en vergers de pommiers. La thèse permettra d’étudier plus particulièrement l’impact des chauves-souris sur la dynamique des populations de certains ravageurs problématiques tels que le Carpocapse de la pomme, mais également leur prédation d’espèces plus précoces problématiques dans certaines parcelles en agriculture biologique telles que les Hoplocampes et les Anthonomes. Ces dernières pourraient notamment être consommées par les Chiroptères en sortie d’hibernation, période sensible pour la survie des chauves-souris du fait notamment d’une faible quantité de proies disponibles. Enfin, au vu de l’importance cruciale de la connectivité du paysage pour les déplacements des chauves-souris, l’impact du contexte paysager sur le niveau de prédation et sur la synchronisation entre prédation et pics de ravageurs sera évalué. Cette thèse s’inscrit dans un projet national mené et financé par L’Office Français de la Biodiversité sur la conservation des chiroptères et leur rôle de régulation dans les paysages de vergers.

Partenaires de thèse: 

Implanteus Graduate School

Liens connexes:

Article court Chauves-souris dans les espaces agricoles https://www.vigienature.fr/fr/actualites/chauves-souris-espaces-agricoles-3840

Note nationale Biodiversité - chauves-souris https://driaaf.ile-de-france.agriculture.gouv.fr/IMG/pdf/10-note_nationale-chauves-souris.pdf

Supports des présentation du premier colloque national chauves-souris et agricultures: https://drive.google.com/drive/u/1/folders/1SJyiuLpVNbdHNHx5Ng0DlK78FneBx_uL

• TOM SOUHIL:

Intitulé de thèse: "Déterminants de la diversité taxonomique et fonctionnelle des communautés d'arthropodes dans des paysages de cultures pérennes".

Financements: 50% INRAE – 50% Implanteus

Dates: 01/11/2024 au 31/10/2027

Objectifs: On assiste actuellement à un effondrement de l’abondance et de la diversité des arthropodes, notamment en milieux agricoles. Les deux principales causes proposées sont la simplification des paysages et l’usage des pesticides (notamment des insecticides) mais d’autres pratiques peuvent aussi impacter les arthropodes et leurs effets sont mal documentés, d’autant que certains peuvent dépendre du contexte paysager.  L’impact de ces changements sur les arthropodes est le plus souvent évalué à travers la diversité locale (diversité alpha) d’un assemblage d'espèces sans analyser les effets sur la composition en espèces ou en traits et leurs patrons de variation d’un assemblage à l’autre alors que l'analyse de ces composantes nous renseigne sur les règles d'assemblages et leurs déterminants. A l'aide d'un jeu de donnée pluriannuel, l'objectif sera de mieux comprendre les processus qui régissent la diversité taxonomique et fonctionnelle des arthropodes dans un ensemble de vergers différant par leurs pratiques locales ainsi que par leur environnement paysager (en termes d’occupations du sol et de pratiques agricoles). Au-delà de la compréhension des mécanismes écologiques, ces travaux permettront d’identifier des pistes de recommandations en termes de conservation et d'aménagement des paysages agricoles.

Partenaire de la thèse:

EUR Implanteus

• RAPHAEL MINGUET

Intitulé de thèse: "Étude de l’effet des pratiques agricoles sur les oiseaux par des approches acoustiques"

Financements: Tersys

Dates: 01/10/2023 au 31/10/2026

Objectifs: Les oiseaux ont vu leurs effectifs chuter drastiquement au cours des dernières décennies. L’agriculture est identifiée comme l’un des principaux facteurs de ce déclin à l’échelle européenne. Continuer à documenter les effets des pratiques agricoles sur l’avifaune est essentiel afin de mettre en place des moyens de production en adéquation avec les enjeux de biodiversité. Dans ce cadre, la combinaison de l’écoacoustique passive et le développement d’algorithmes d’identification automatique des vocalisations d’oiseaux offre de grandes opportunités pour obtenir des informations complémentaires aux suivis classiques. Ce travail vise à évaluer l’utilisation de ces outils et à identifier les effets des pratiques dans les vergers de pommiers sur différentes composantes de l’écologie des oiseaux : la dynamique des communautés et des populations, le potentiel des vergers pour l’accueil des espèces migratrices, et l’influence des pratiques sur la phénologie journalière du chant des passereaux.

Partenaires de la thèse:

IMBE

• LÉA GINQUENEAU 

Intitulé de thèse: "Multi-résistance du carpocaspe des pommes (Cydia pomonella) à des isolats de granulovirus (CpGV), quelles bases génétiques ? Comment la contourner de manière durable ?".

• ISIS POINAS

Intitulé de thèse: "Effets des combinaisons de pratiques agricoles à l’échelle locale et paysagère sur les dégâts de bioagresseurs, les auxiliaires et l’utilisation de produits phytosanitaires en arboriculture".